Главная » 2014 » Июль » 16 » Скачать Тандемные системы бинарных олигонуклеотидных производных: исследование закономерностей сенсибилизированной фотомодификации бесплатно
9:40 PM
Скачать Тандемные системы бинарных олигонуклеотидных производных: исследование закономерностей сенсибилизированной фотомодификации бесплатно
Тандемные системы бинарных олигонуклеотидных производных: исследование закономерностей сенсибилизированной фотомодификации биополимеров
Диссертация
Автор: Гайнутдинов, Тимур Имильевич
Название: Тандемные системы бинарных олигонуклеотидных производных: исследование закономерностей сенсибилизированной фотомодификации биополимеров
Справка: Гайнутдинов, Тимур Имильевич. Тандемные системы бинарных олигонуклеотидных производных: исследование закономерностей сенсибилизированной фотомодификации биополимеров : диссертация кандидата биологических наук : 02.00.10 Новосибирск, 2003 106 c. : 61 04-3/671
Объем: 106 стр.
Информация: Новосибирск, 2003
Содержание:
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
11 Фотодинамическая терапия
111 Фотохимические основы ФДТ
1111 Воздействие синглетного кислорода (фотодинамический эффект II типа)
1112 Фотоокисление с участием радикальных частиц и переноса электрона (фотодинамический эффект I типа)
112 Фотосенсибилизаторы, применяемые в фото динамической терапии рака
1121 Сенсибилизаторы первого поколения на основе порфиринов
1122 Сенсибилизаторы второго поколения Производные хлорофилла а и бактериохлорофилла а Синтетические хлорины и бактериохлорины Тетраазапорфирины Аналоги порфиринов
113 Транспорт и распределение фотосенсибилизаторов в организме
1131 Распределение фотосенсибилизаторов в организме Транспорт и распределение фотосенсибилизаторов гидрофобной природы Транспорт и распределение водорастворимых фотосенсибилизаторов
114 Патофизиологические процессы, вызывающие некроз клеток
1141 Реакции, сенсибилизируемые в клетке
1142 Острая воспалительная реакция (ранняя фаза) Высвобоэюдение биологически активных ионов Высвобождение биологически активных веществ
1143 Отложенная воспалительная реакция (поздняя фаза) Активация системы комплемента Клеточные реакции и гистологические изменения
115 Недостатки, ограничения и пути совершенствования методов фотодинамической терапии
12 Сенсибилизированная фотомодификация ДНК бинарными системами олигонуклеотидных реагентов
121 Синглет-синглетный перенос энергии
122 Двухквантовое резонансное триплет-триплетное возбуждение
123 Перспективы использования фотореагентов для направленной модификации нуклеиновых кислот in vivo
ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
21 Материалы
22 Олигонуклеотиды
23 Методы
231 Получение фотоактивируемых реакционноспособных производных олигонуклеотидов
232 Синтез производных олигонуклеотидов, несущих остаток сенсибилизатора
233 Выделение олигонуклеотидных производных методом ВЭЖХ
234 Гашение флуоресценции периленильных производных
236 Фотомодификация нуклеиновых кислот
237 Электрофоретический анализ продуктов модификации, радиоавтография и денситометрия
238 Определение степени и позиционной направленности модификации ДНК-мишени
239 Культивирование клеток
2310 Модификация клеточных белков фотоактивируемым производным олигонуклеотида
2311 Электрофоретический анализ белков
ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
31 Влияние нуклеотидной последовательности ДНК-мишени на эффективность сенсибилизированной фотомодификации
311 Сенсибилизированная фотомодификация ДНК-мишеней Ml и М
312 Сенсибилизированная фотомодификация ДНК-мишени МЗ
32 Влияние строения сенсибилизатора на скорость и эффективность сенсибилизированной фотомодификации ДНК
321 Влияние заместителей в антраценовом остатке
3211 Строение и спектрально-люминесцентные свойства сенсибилизаторов на основе антрацена
3212 Сенсибилизированная фотомодификация ДНК-мишени
33 Использование перилена в качестве сенсибилизатора
331 Спектрально-люминесцентные свойства перилена
332 Гашение флуоресценции олигонуклеотидного производного перилена в двуцепочечных комплексах
333 Сенсибилизированная фотомодификация ДНК-мишени
334 Механизм сенсибилизации фотореагента основан на переносе электрона
34 Сенсибилизированная фотомодификация олигонуклеотид-связывающих белков, представленных на поверхности эукариотических клеток
ВЫВОДЫ
Введение:
Фотореакционноспособные производные олигонуклеотидов являются перспективными реагентами для направленной химической модификации определенных последовательностей нуклеиновых кислот и инструментами для исследования структуры и функции биополимеров [1,2].Фотореакционноспособные конъюгаты олигонуклеотидов обладают рядом преимуществ по сравнению с другими реагентами на основе олигонуклеотидов - они инертны в отсутствие облучения, а процесс фотоактивации легко регулировать. Фотоактивация позволяет повысить селективность воздействия - реакция преимущественно проходит в сформированном аффинном комплексе. Фотоактивные антисмысловые олигонуклеотиды могут связываться с целевыми мРНК и, после облучения, ингибировать их трансляцию. Они способны образовывать трехтяжевые комплексы с двуцепочечной ДНК и ингибировать репликацию и транскрипцию генов in vitro и in vivo. Фотоактивируемые конъюгаты олигонуклеотидов могут взаимодействовать с белками, обладающими сродством к нуклеиновым кислотам, что позволяет применять их для исследования механизмов взаимодействия белков с нуклеиновыми кислотами и модулировать активность белков in vivo.Бинарные системы олигонуклеотидных конъюгатов позволяют осуществить фотомодификацию ДНХ с повышенной эффективностью и селективностью [3-8]. Принцип подхода заключается в том, что используются два олигонуклеотида, комплементарные соседним участкам ДНК- или РНК-мишени, к одному из которых присоединен сенсибилизатор, к другому - фотореагент. При комплементарном связывании таких пар олигонуклеотидных конъюгатов с нуклеиновой кислотой сенсибилизатор и фотореагент сближаются, в результате чего формируется фотореакционноспособный центр. Облучение образовавшегося комплекса длинноволновым светом вызывает возбуисдение сенсибилизатора с последующей активацией реагента за счет безизлучательного переноса энергии и фотомодификацию биополимера.Фотомодификация нуклеиновых кислот и белков взаимодействующих с РНК и ДНК бинарными системами олигонуклеотидных конъюгатов может быть использована как инструмент в исследовательских, диагностических и терапевтических целях. В условиях in vivo исключительно важно, чтобы фотомодификация инициировалась видимым или ИК-светом, более глубоко проникающим в клетки и не вызывающим, в отличие от коротковолнового УФ, нежелательных побочных эффектов облучения. Поэтому применение бинарных систем олигонуклеотидных конъюгатов активизируемых длинноволновым светом особенно перспективно для приложения in vivo.Целью данной работы являлось: а) - разработка новых, активируемых видимым светом, бинарных систем производных олигонуклеотидов для фотосенсибилизированной модификации биополимеров; б) - изучение влияния химической структуры сенсибилизатора и влияния последовательности целевой нуклеиновой кислоты на эффективность фотомодификацию ДНКмищени; в) - использование бинарных систем конъюгатов олигонуклеотидов для исследования процессов взаимодействия нуклеиновых кислот с клеточными белками in vivo.
